SARS-CoV-2を検出するためのRT-PCRテストの外部ピアレビューにより、分子レベルおよび方法論レベルでの10の本質的な科学的欠点が明らかになりました。偽陽性結果の結果。

親愛なる読者の皆様、今日はアルバート・アインシュタイン教授からの引用から始めます（ユナイテッドジューイッシュアピールのラジオ放送、11年1943月XNUMX日から):

「真実と知識の追求は、その追求に最も満足していない人々の唇にこの追求のプライドがほとんどあるとしても、人ができる最も美しいことのXNUMXつです。」

世界はほぼXNUMX年になります コロナパンデミック 雇用された。 状況を管理するために非常に多くの対策が講じられてきました。 DTTサイエンスタンクチームでは、コロナパンデミックのトピックに取り組んだことはありません。 理由は非常に単純です。 トピックに関する科学的意見を形成するためには、特に科学において、健全で敬意を表する論争が必要です。 優れた科学者は常にそれを行ってきました。 量子物理学の歴史と科学者間のさまざまな伝説的な確執を見るだけで、科学がどのように機能するかを学ぶことができます。 残念ながら現在に起こった コロナ危機 今まで、適切な論争にうんざりすることはほとんどありませんでした。

言うまでもなく、政府によるさまざまな措置の基礎は PCRテスト 表します。

2019年初頭に公開された作品： リアルタイムRT-PCRによる2019年の新規コロナウイルス（2019-nCoV）の検出 -ここにあります（https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045)

著者:

ビクター・M・コーマン、オルフェルト・ランド、マルコ・カイザー、リチャード・モーレンカンプ4、アダム・マイヤー、ダニエル・KWチュー6、トビアス・ブライカー1、セバスチャン・ブリュニンク、ジュリア・シュナイダー、マリー・ルイサ・シュミット1、ダフネGJCマルダース4、バート・L・ハーグマン、バス・ファン・デル・ビア、シャロン・ヴァン・デン・ブリンク、Lisa Wijsman、Gabriel Goderski、Jean-Louis Romette、Joanna Ellis、Maria Zambon、Malik Peiris、Herman Goossens、Chantal Reusken、Marion PG Koopmans、Christian Drosten   

知られている。 それは、これまでも、そしておそらく今でも、 PCRテスト.

作品の詳細に立ち入ることなく、ひとつになりたいと思います レビューレポート 注意を引くために：

画像ソース：Pixabay

SARS-CoV-2を検出するためのRTPCRテストの外部ピアレビューにより、分子レベルおよび方法論レベルで10の主要な科学的欠陥が明らかになりました：偽陽性結果の結果 -ここにあります（https://cormandrostenreview.com/report/)      

著者：

Pieter Borger、Bobby Rajesh Malhotra、Michael Yeadon、Clare Crai、Kevin McKernan、Klaus Steger、Paul McSheehy、Lidiya Angelova、Fabio Franchi、Thomas Binder、Henrik Ullrich、Makoto Ohashi、Stefano Scoglio、Marjolein Doesburg-van Kleffens、Dorothea Gilbert Klement、Ruth Schruefer、Berber W. Pieksma、Jan Bonte、Bruno H. Dalle Carbonare、Kevin P. Corbett、UlrikeKämmerer             

      
この記事は、レビューの要点をドイツ語に翻訳することについてです：出典（https://cormandrostenreview.com/report/):

SARS-CoV-2を検出するためのRT-PCRテストの外部ピアレビューにより、分子レベルおよび方法論レベルでの10の本質的な科学的欠点が明らかになりました。偽陽性結果の結果。

「」というタイトルの出版物でリアルタイムRT-PCRによる2019年の新規コロナウイルス（2019-nCoV）の検出「（Eurosurveillance25（8）2020）著者は、2019-nCoV（現在は SARS-CoV2）検証されており、公衆衛生研究所で使用するための堅牢な診断方法を提供していると彼らは主張しています。 世界中の社会に対するこの出版物の影響を考慮して、独立した研究者のグループが上記の出版物のポイントごとのレビューを実施しました。

1）提示されたテスト設計のすべてのコンポーネントがクロスチェックされている。

2） RT-qPCRプロトコルの推奨事項 優良試験所基準について評価されています

と

3）パラメータは、この分野の関連する科学文献を使用して調査されています。

公開された RT-qPCRプロトコル 2019-nCoVの検出と診断のために-nCoVと原稿は、不適切なプライマー設計、問題のある不適切なものなど、多くの技術的および科学的エラーを示しています RT-qPCRプロトコル そして正確な欠如 テスト検証。 提示されたテストも原稿自体も、許容できる科学出版物の要件を満たしていません。 さらに、著者の深刻な利益相反については言及されていません。 最後に、出版物の提出から受理までの非常に短い期間（24時間）は、体系的であることを示唆しています。 ピアレビュープロセス ここでは、実行されなかったか、問題のある品質が低下しています。 私たちは、いくつかの科学的不備の説得力のある証拠を提供します。 欠陥と欠陥。

ここに提示された科学的および方法論的な欠点を考慮して、私たちはの編集スタッフが ユーロ監視 公開するしかない 撤退する.

紙に見つかった欠陥の要約カタログ

インクルード コーマン-ドロステン紙 次の特定のエラーが含まれています。

1.このプロトコルでこれらの非常に高濃度のプライマーを使用する理由は特にありません。 記載されている濃度は、非特異的結合とPCR産物の増幅の増加につながり、SARS-CoV-2ウイルスを検出するための特定の診断ツールとしてテストを不適切にします。

2. 2つの不特定のぐらついた位置は、このテストの実際の実験室での実装に大きな変動をもたらします。 Corman-Drostenの論文の紛らわしい不特定の説明は、標準の作業プロトコルとしては適切ではないため、SARS-CoV-XNUMXウイルスを特定するための特定の診断ツールとしては不適切です。

3.テストでは、ウイルス全体とウイルスフラグメントを区別できません。 したがって、このテストを無傷の（感染性）ウイルスの診断ツールとして使用することはできません。つまり、このテストは、SARS-CoV-2ウイルスを特定するための特定の診断ツールとしては不適切であり、感染。

4.プライマーペア10（RdRp_SARSr_FおよびRdRp_SARSr_R）のアニーリング温度Tmに対する1°Cの違いも、SARS-CoV-2ウイルスを特定するための特定の診断ツールとしてテストを不適切にします。

5.致命的なエラーは、サンプルが正および負と見なされるCt値がないことです。 このCt値は後続のアプリケーションにも見られないため、SARS-CoV-2ウイルスを検出するための特定の診断ツールとしてテストは不適切です。

6.PCR産物は分子レベルで検証されていません。 この事実により、このプロトコルは、SARS-CoV-2ウイルスを検出するための特定の診断ツールとして使用できなくなります。

7. PCRテストには、SARS-CoV-2に対する特異性を評価するための明確なポジティブコントロールも、他のコロナウイルスの存在を除外するためのネガティブコントロールも含まれていません。これにより、テストはSARS-CoV-2を特定するための特定の診断ツールになります。 。ウイルスは不適切です。

8. Corman-Drostenの論文のテスト設計は非常に曖昧で欠陥があるため、数十の異なる方向に進むことができます。 標準化されたものはなく、SOPもありません。 これは、テストの科学的妥当性に強く疑問を投げかけ、SARS-CoV-2ウイルスを特定するための特定の診断ツールとしては不適切になります。

9.おそらく、Corman-Drostenの論文は査読されていなかったため、SARS-CoV-2ウイルスを特定するための特定の診断ツールとしてテストは不適切でした。

10. Corman-Drostenの論文の著者のうち29人（ChristianDrostenとChantalReusken）がEurosurveillance編集委員会のメンバーであるという事実に加えて、少なくとも2020人の著者に深刻な利益相反が見られます。 20年21月XNUMX日に利益相反が追加されました（Olfert LandtはTIB-Molbiolのマネージングディレクター、Marco KaiserはGenExpressの主任研究員であり、TIB-Molbiolの科学顧問を務めています）。 PubMedバージョンではまだ欠落しています）; TIB-Molbiolは、Corman-Drosten原稿で公開されたプロトコルに基づいてPCRキット（Light Mix）を「最初に」製造し、それ自体の言葉で、公開前からこれらのPCRテストキットを販売した会社です[XNUMX ]; さらに、ビクター・コーマンとクリスチャン・ドロステンは、彼らのXNUMX番目の所属である商業試験所「労働ベルリン」については言及していませんでした。 どちらもそこでウイルス診断を担当しており[XNUMX]、同社はリアルタイムPCRテストの分野で活躍しています。

結論

どのテストプロトコルを公開し、一般的にアクセス可能にするかについての決定は、Eurosurveillanceの手に委ねられています。 Corman-Drostenの研究で明らかな誤りを認識するという決定には、将来、人々のコストと苦痛が大幅に最小限に抑えられるという利点があります。
この論文を撤回することは、Eurosurveillanceの最大の利益ではありませんか？ 私たちの結論は明らかです。 ここで説明されている途方もないPCRプロトコル設計の欠陥と欠陥のすべてを考えると、科学的完全性と責任の枠組みの中で多くの選択肢が残されていないと結論付けます。

[1] Corman Victor M、Landt Olfert、Kaiser Marco、Molenkamp Richard、Meijer Adam、Chu Daniel KW、Bleicker Tobias、BrüninkSebastian、Schneider Julia、Schmidt Marie Luisa、Mulders Daphne GJC、Haagmans Bart L、van der Veer Bas、van den Brink Sharon、Wijsman Lisa、Goderski Gabriel、Romette Jean-Louis、Ellis Joanna、Zambon Maria、Peiris Malik、Goossens Herman、Reusken Chantal、Koopmans Marion PG、Drosten Christian リアルタイムRT-PCRによる2019年の新規コロナウイルス（2019-nCoV）の検出。 ユーロ監視。 2020; 25（3）：pii = 2000045。 https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045

[2]博士間の電子メール通信。 ピーターボーガー＆博士アダムマイヤー：補足資料

[3] Jafaar et al。、3790定量的ポリメラーゼ連鎖反応間の相関–陽性サンプルと陽性細胞培養（1941年重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2分離株を含む）。 https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1491/5912603

[4] BBC、21年2020月51185836日：https：//www.bbc.com/news/world-asia-china-XNUMX;
アーカイブ： https://archive.is/0qRmZ

[5] Google Analytics-COVID19-世界中で死亡：https：//bit.ly/3fndemJ
アーカイブ： https://archive.is/PpqEE

[6] COVID-19緊急対応テクニカルセンター、NIVDの実験室試験
中国CDC 15年2020月XNUMX日： http://www.chinacdc.cn/en/COVID19/202003/P020200323390321297894.pdf

[7]リアルタイムPCRハンドブックLifeTechnologies：https：//www.thermofisher.com/content/dam/LifeTech/global/Forms/PDF/real-time-pcr-
handbook.pdf Nolan T、Huggett J、Sanchez E.定量PCR（qPCR）First Edition2013のアプリケーションに関するグッドプラクティスガイド

[8] Trestan Pillonel et al、編集者への手紙：リアルタイムRT-PCRによるSARS-CoV-2検出： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7268274/

[9]クルケラ、サトゥ、デビッドWGブラウン。 「分子診断技術」。 医学38.10
（2009）：535-540。

[10] Wolfel et al。、COVID-2019の入院患者のウイルス学的評価
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2196-x

[11] Thermofischer Primer Dimer Webツール：https：//www.thermofisher.com/us/en/home/brands/thermo-scientific/molecule-biology/molecule-biology-learning-center/molecule-biology-resource-library /thermo-scientific-web-tools/multiple-primer-analyzer.html

[12]入門書-BLAST、NCBI-国立バイオテクノロジー情報センター： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

[13] Marra MA、Steven JMJ、Caroline RA、Robert AH、Angela BW etal。 （2003）科学。 SARS関連コロナウイルスのゲノム配列。 Science 300（5624）：1399-1404

[14]重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2は武漢-Hu-1を分離し、完全なゲノム： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947

[15] Borger P. SARSのようなコロナウイルスが予想されたが、準備するために何もされなかった。 J Biomed Sci Res2020にて。https：//biomedgrid.com/pdf/AJBSR.MS.ID.001312.pdf
https://www.researchgate.net/publication/341120750_A_SARS-like_Coronavirus_was_Expected_but_nothing_was_done_to_be_Prepared;  アーカイブ：https：//archive.is/i76Hu

[16] Eurosurveillanceの紙の評価/レビュープロセス：https：//www.eurosurveillance.org/evaluation

[17] 13年2020月1.0日にドキュメントのバージョンXNUMXとして公開された、WHOによるCorman-Drostenプロトコルおよび原稿の公式推奨：https：//www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/wuhan-virus -アッセイ-
v1991527e5122341d99287a1b17c111902.pdf; archive: https://bit.ly/3m3jXVH

[18] Corman / Drosten RT-qPCRプロトコルに関するWHOの公式勧告。これは、Eurosurveillance-publication、document-version 2-1から直接派生したもので、
17th January 2020: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2

[19] Eurosurveillance編集委員会、2020年： https://www.eurosurveillance.org/upload/site-assets/imgs/2020-09-Editorial%20Board%20PDF.pdf; アーカイブ：https：//bit.ly/2TqXBjX

[20]使用説明書LightMixSarbecoV E-gene plus EAV Control、TIB-Molbiol＆Roche Molecular Solutions、11年2020月40日：https：//www.roche-as.es/lm_pdf/MDx_0776-96_200204_Sarbeco-E-gene_V09164154001_1（XNUMX ）.pdf
アーカイブ、タイムスタンプ-11年2020月XNUMX日： https://archive.is/Vulo5;  アーカイブ： https://bit.ly/3fm9bXH [21]労働ベルリンでウイルス診断を担当するクリスチャン・ドロステンとビクター・コーマン：
https://www.laborberlin.com/fachbereiche/virologie/  アーカイブ：https：//archive.is/CDEUG

[22]トム・ジェファーソン、エリザベス・スペンサー、ジョン・ブラッシー、カール・ヘネガンCOVID-19感染性評価のためのウイルス培養。 系統的レビュー。 システマティックレビューdoi：https：//doi.org/10.1101/2020.08.04.20167932-XNUMX-XNUMX-XNUMX https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.08.04.20167932v4

[23] Kim et al。、The Architecture of SARS-CoV-2 Transcriptome：https：//www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420304062

[24] ECDCは博士に返答します。 Peter Borger、18年2020月XNUMX日：補足資料

[25]教授博士。 UlrikeKämmerer＆チーム、調査＆プライマー-BLASTテーブル